Jsme v roce 2009. Uplynulo několik let od doby, kdy se členové BSAA Chris Redfield a Jill Valentine pokusili zatknout Ozwella E. Spencera v jeho sídle v Evropě, pouze aby objevili Alberta Weskera stojícího nad Spencerovou mrtvolou. Začal souboj, ve kterém měl Wesker navrch. Jill, aby zachránila Chrise před jistou smrtí, skočila po Weskerovi a sebe i jeho prohodila oknem nad vysokým útesem. Těla nebyla nikdy nalezena a oba byli prohlášeni za mrtvé.
Chris nyní jede na misi do Autonomní oblasti Kijuju v Africe, aby se zde setkal se svou partnerkou Shevou Alomar. Společně s několika jednotkami mají zastavit Ricarda Irvinga, který zde plánuje prodávat viry na černém trhu. Hned na začátku pátrání zpozorují, jak dva černoši cpou do úst třetímu podivnou věc nebo snad živočicha, díky čemuž se v momentě promění v „majini“ (ve svahilštině to znamená zlý duch), který na oba zaútočí. Brzy zjišťují, že většina populace je zde takto infikovaná. Je to Irvingův plán, jak BSAA znemožnit jeho dopadení. Dvojice záhy také objeví, že celý Alfa tým je mrtvý kromě jednoho člena, ten je ovšem také smrtelně zraněn, ale před zesnutím stihne dát Chrisovi důležitá data týkající se mise. Monstrum (infikované novým typem viru Uroboros), které vyvraždilo Alfa tým, si najde také Chrise a Shevu, ale podléhá jejich zkušenosti v boji.
